Epifanijos vienuolynas Kremenece buvo pastatytas 1633 m., gavus Sandraugos karaliaus leidimą, kaip vyrų vienuolynas. 1636 m. Kijevo metropolitas Petras Mohyla paskelbė Kremeneco vienuolyną ir broliją pavaldi Konstantinopolio patriarchui ir jo eksarchui Ukrainoje – metropolitu, o Kremeneco brolijos uždavinys – stačiatikybės apsauga rajone. Vienuolyne buvo įkurta mokykla, spaustuvė ir ligoninė – pirmoji Kremenece. 1701 m. pasirašius uniją, vienuolynas tapo unitu.
Kremenecą įjungus į Rusijos imperiją, Epifanijos vienuolyno pastatai buvo perkelti į Kremeneco licėjų – buv. Collegium, o pats vienuolynas buvo perkeltas į buvusio katalikų vienuolyno bažnyčią ir celes. Epifanijos vienuolynas dabartines patalpas gavo 1839 m., o nuo 1873 m. buvo Voluinės vyskupijos vikaro - Ostrožės (Kremenec) vyskupo rezidencija. Nuo 1919 metų čia veikė stačiatikių dvasinė seminarija. 1953 m. vienuolynas tapo moterų vienuolynu, o 1959 m. buvo panaikintas. 1990 m. rugpjūčio 26 d. – Epifanijos vienuolyno atgimimo data, kai čia iš Počajevo procesija buvo perkelta Skausmingosios Dievo Motinos ikona.