Vienuolynas įkurtas 1672-1688 metais (kitais šaltiniais – XVI a. antroje pusėje). Senosios ir Naujosios Samaros upių suformuotoje saloje. Kazokai čia pastatė tvirtovę su Šv. Nikolajus, ligoninė ir būstas sergantiems ir pagyvenusiems kazokams.

Vienuolynas buvo svarbiausia kazokų šventovė, priklausė nuo Zaporožės Sicho ir buvo kontroliuojamas Sič Kosho, buvo laikomas kariniu. Vienuolynas pasirodė esąs patikimas kazokų forpostas Rusijos ir Turkijos karuose 1735–1739 ir 1768–1774 m. Per paskutinį iš jų vienuolynas priglaudė daug nelaisvėje esančių totorių ir turkų. Su jais buvo elgiamasi taip gerai, kad daugelis jų buvo pakrikštyti vienuolyne, o kai kurie, pasibaigus karui, tapo vienuoliais.

1782-1787 metais. čia iškilo mūrinė altoriaus bažnyčia. Nuo 1791 m. vienuolynas, kaip artimiausias Jekaterinoslavui, buvo paskirtas vyskupų buveine (priemiesčio vyskupo namais). Pagrindinės šventovės yra Akhtyrkos Dievo Motinos ikona, vadinama „Samarskaya“, ir Šv. Nikolajus Stebuklų kūrėjas. Šventyklos: Nikolajevskis su koplyčia Šv. Kirika ir Julita; Kryžius prie vyskupo rūmų. Vienuolyne veikė berniukų mokykla.
Po sovietų valdžios pergalės vienuolynas buvo uždarytas. 30-aisiais jame buvo atidaryti slaugos namai, vėliau – protiškai atsilikusių internatas. 1993 metais vienuolyno pastatuose parapija buvo atgaivinta, o po dvejų metų vėl atidaryta kaip vienuolynas. 1998 m. kovo 12 d., palaiminus UOC Šventąjį Sinodą, vienuolynas ir Šv. Mikalojaus parapija buvo paversti vyrų vienuolynu.

Vienuolynas stovi gražiame lapuočių miške. Į jį veda gana geras kelias. Nuostabus oras, rami tyla laukia jūsų, jei nuspręsite čia atvykti. Vienuolynas yra atviras lankytojams, todėl galite saugiai patekti į jo teritoriją, aplankyti šventyklą ir pasikalbėti su vienuolyno abatu tėvu Dozitejumi.