Дерев’яний костел був побудований у XIV столітті. В I половині XV століття, після пожежі, за розпорядженням короля Владислава Ягелло був побудований готичний костел. Нинішній костел побудований після знесення готичного на кошти Краківської Академії у 1689-1703 роках за проектом Тильмана де Гамерена. Це одна з найкрасивіших барочних будівель Польщі – тринефна базиліка, що покрита циліндричним перекриттям з люнетами і куполом. По обох боках фасаду башти, які увінчані пізньобарочними шлемами за проектом ксьондза Себастьяна Сераковського. Інтер’єр храму прикрашає красивий скульптурний і архітектурний декор Бальтазара Фонтана, а також живописний декор Кароля Данкварта.
В головному олтарі знаходиться картина св. Анни, твір Єжи Елеутера Семигиновського (1699-1703); по боках скульптури святих Станіслава и Войцеха (Б. Фонтана, 1701). В храмі стоїть мавзолей св. Яна Кантського, покровителя Ягеллонського університету, причисленого до лику святих в 1767 р. Олтар виконав Бальтазар Фонтана в 1695-1703 рр. Поряд з мавзолеєм розміщені численні дари і реліквії, наприклад турецькі бунчуки, що добуті у 1683 році під Віднем Яном ІІІ Собеським.
Праворуч від головного входу – меморіальна дошка, яка свідчить, що 8 червня 1997 року римський папа Іоанн Павло ІІ зустрічався тут з польськими науковцями під час святкування 600-ліття теологічного факультету Ягеллонського університету і молився при реліквіях св. Яна Кантського.
Вулиця святої Анни, на якій стоїть костел, доволі вузька, і навіть сфотографувати його у повному обсязі складно.
Medinė baž nyč ia pastatyta XIV a. XV amž iaus pirmoje pusė je po gaisro karaliaus Vladislovo Jogailos į sakymu buvo pastatyta gotikinė baž nyč ia. Dabartinė baž nyč ia buvo pastatyta 1689-1703 m. nugriovus gotiką Krokuvos akademijos lė š omis pagal Tilmano de Gamereno projektą . Tai vienas graž iausių baroko pastatų Lenkijoje – trijų navų bazilika, dengta cilindrinė mis lubomis su liunetė mis ir kupolu. Abiejose bokš to fasado pusė se, kurių virš uje yra kun. Sebastiano Serakovskio sukurti vė lyvojo baroko š almai. Š ventyklos interjerą puoš ia graž us skulptū rinis ir architektū rinis Baltazar Fontana dekoras, taip pat vaizdingas karaliaus Dankvarto dekoras.
Pagrindiniame altoriuje yra paveikslas Š v. Anna, Jerzy Eleuther Semiginovskio (1699-1703) darbas; š ventų jų Stanislovo ir Wojciecho skulptū ros š onuose (B. Fontana, 1701). Baž nyč ioje yra mauzoliejus Š v.
Jonas Kantskis, Jogailos universiteto globė jas, paskelbtas š ventuoju 1767 m. Altorių padarė Baltazaras Fontana 1695-1703 m.
Deš inė je nuo pagrindinio į ė jimo yra memorialinė lenta, kurioje raš oma, kad 1997 metų birž elio 8 dieną popiež ius Jonas Paulius II č ia susitiko su lenkų mokslininkais, š vę sdamas Jogailos universiteto Teologijos fakulteto 600 metų jubiliejų ir meldė si prie Š v. Janas Kantskis.
Onos gatvė , kurioje stovi baž nyč ia, gana siaura, net sunku ją visą nufotografuoti.