Nacionalinis istorijos muziejus atsirado padalijus Gamtos istorijos muziejaus kolekciją į du muziejus, iš kurių antrasis yra Nacionalinis antropologijos muziejus. Istorijos muziejus įsikūręs Chapultepec rūmuose, buvusioje Meksikos prezidento rezidencijoje, aukščiausioje to paties pavadinimo parko vietoje. 20 muziejaus salių eksponuojama daugiau nei 150 000 XVI–XX a. objektų: senoviniai baldai, ginklai, kostiumai, papuošalai, plakatai, rašytiniai dokumentai ir nuotraukos, monetos ir medaliai, senosios graviūros, skulptūros ir paveikslai. Rūmų sienas puošia daugelio garsių Meksikos menininkų freskos. Viršutiniame muziejaus aukšte yra nedidelė diorama, atkurianti pilies kambarius Meksikos imperatoriaus Maksimiliano I (von Habsburgo) valdymo laikais, gyvenusio rūmuose su žmona Belgijos princese Charlotte.
Muziejaus pastate taip pat yra suvenyrų parduotuvė, nedidelė biblioteka, auditorija, kavinė.