Vatikano muziejai yra didžiulis muziejų kompleksas, apimantis atskiras senovės Romos kolekcijas, modernumo, ankstyvųjų krikščionių ir viduramžių bažnytinio meno pavyzdžius, archeologinius radinius, istorinius artefaktus, namų apyvokos daiktus ir knygas. Vatikano muziejai yra istoriniuose Belvederio kambariuose, Pontifikuotuose ir Laterano rūmuose, Vatikano bibliotekoje ir Siksto koplyčia.
Vatikano salės, salonai, galerijos ir apartamentai užpildyti daugybe senovės, etruskų, graikų, egiptiečių, romėnų meno kolekcijų, knygų ir paveikslų – jie visi sudaro 7 kilometrų ilgio parodų taką. Muziejai buvo įkurti XVI amžiaus pradžioje. popiežius Julijus II ir daugelį amžių toliau papildytas ir plečiamas kitų popiežių.
Šiame komplekse yra grigališkojo muziejai – Egipto (sarkofagų, granito statulų, mirties kaukių ir kitų archeologinių radinių kolekcija) ir etruskų (terakotos vazos ir bronza, urnos, senoviniai papuošalai, architektūros fragmentai, sarkofagai ir kitas etruskų paveldas); Pijaus-Klementino skulptūrų muziejus (senovinės statulos, marmurinės vonios ir daug daugiau); Chiaramonti muziejus (skirtas senovinei skulptūrai ir senoviniams religiniams užrašams); Candelabra galerija (II a. žvakidžių kolekcija, vazos, freskos, statulos ir sarkofagai); Arazzi arba gobelenų galerija; Geografinių žemėlapių galerija; nuostabios Rafaelio lodžijos ir strofai; Etnologiniai misionieriai (religijos istorijos ekspozicija) ir Istoriniai (iliustruoja Vatikano valstybės ir popiežių istoriją) muziejai; Apaštališkoji biblioteka (rankraščiai, rankraščiai, graviūros, žemėlapiai, inkunabulai, numizmatikos rinkiniai); Pinakoteka (daugiau nei 450 religinių ir altorių paveikslų kolekcija); Pio-Cristiano muziejus (objektai rasti Romos katakombose); Nicolina koplyčia (unikalios Fra Beato Angelico freskos); Borgia apartamentai (Sivilų salė, Šventųjų salė ir Tikėjimo sakramentų salė – piešė Pinturicchio ir jo mokiniai); Šiuolaikinio religinio meno galerija ir neįkainojama Siksto koplyčia (Mikelandželo lubų freskos).